９、更名为湖南医科大学
１９８７年１２月，学校基于事业的发展，报请湖南省政府、国家卫生部同意，国家教委批准，更名为湖南医科大学。１９８８年１月，学校启用新印章。
１９８８年５月，学校拥有医疗、卫生、检验、口腔、医学图书情报、麻醉等６个系和精神卫生专业。在医疗专业中有五年制本科专业、六年制医学英语班、七年制临床医学班和大专班，还有中等卫校及大学后继续教育、成人教育等。全校各类在校学生４７４７人，有７８个教研室，１４个学科专业有博士学位授予权，２５名博士生指导教师；３８个学科专业有硕士学位授予权；由国家有关部门确定，建立了医学遗传学国家重点实验室；并先后建成了医学遗传学、临床药理学与英语培训三个国家级培训中心，有３２个学科课程被卫生部认可为“全国性医学教育基地课程”，成了全国性医学进修教育基地之一。学校科研编制已扩充到３６０人，设有研究所５个，研究室３６个，研究水平已由７０年代的细胞水平提高到了超微结构的分子水平。两所附属医院的病床已增至１６８０张，年门诊量已达１１０多万人次。全校教职工５２００人，其中技术人员４１６６人，有教授１０８人、副教授级职称人员５６３人、讲师级职称人员１１９３人。
国家给学校下拨的年度经费已达２０００余万元。校园占地１１７９亩，固定资产９６００多万元，总建筑面积累计达３３万多平方米。
对外交流迅速发展。自１９７９年，与美国“中华医学基金会”等组织取得联系，在“不干涉内政、不传教、不妨碍与其它团体发展关系”的条件下，经国务院批准与美国雅礼协会恢复了合作关系。先后与美、日、英等国近十所高校的专业机构建立了较固定的友好交往和学术联系，聘请了２１名美、英、日等国的外籍教师担负了学校的英语、日语等教学任务，邀请了美、日、加拿大、西德、香港等１６个国家和地区的２００余位专家学者来校讲学和传授技术，派出了３５０余人出国进修、访问和参加学术会议。
１０、部省共建，跻身全国百强
１９９６年７月９日，卫生部党组副书记、副部长张文康和中共湖南省委副书记、副省长郑培民在蓉园宾馆共同签署了部、省共同建设湖南医科大学的协议。
协议签署后，仍为卫生部直属高校，原投资渠道不变。卫生部将继续向该校核拨额定事业经费和基建投资以及原来享受的各种专项拨款与补贴，并按部属高校投入的正常增长比例，增加投入。湖南省政府则根据地方经济建设、社会发展实际和该校建设与发展需要，在１９９６－２０１０年间，通过多种形式，平均每年提供不少于１０００万元的共建经费；由省人民政府落实，以使该校享受省属高校的同等待遇。
１９９２年１２月与２５月。湖南医科大学向卫生部与国家教委递交了第一份参与“２１１工程”建设的申请报告。次年６月，学校恳请省委、省政府全力支持，致函国家有关主管部门，推荐进入“全国百强”。校党委、行政两次召开专题会议商讨学校发展计划与对策。１９９３年召开的学校第六次党代会明确提出“用１５年左右时间，把我校建设成为全国培养高层次医学人才、进行高水平医学科研和提供高质量医疗保健服务的重要基地，在总体上居全国先进水平、部分学科在国际上有较大影响的教学科研型大学”的总体建设目标。
历经数载努力，１９９６年１２月，由卫生部和湖南省共同聘请的国家“２１１工程”部门预审专家组对湖南医科大学的“２１１工程”建设进行了预审。专家评审委员会认为：湖南医科大学对重点学科建设的重要性认识比较明确，并在人才培养、科学研究、队伍建设、经费投入等方面做了大量工作，涌现了一批研究方向明确、实力雄厚、设备先进、成果丰硕的优势学科，为进一步加强重点学科建设奠定了良好的基础；该校提出的建设医学遗传学（含生殖工程）、病理生理学、药理学、外科学（含普通外科与胸心外科）、内科学（内分泌与代谢病）、精神病与精神卫生学、中西医结合临床（内科学）、神经病学等８个重点学科的计划是切实可行的。专家组组长、卫生部部长陈敏章对胡冬煦等领导说：“湖南医科大学一直保持了湘雅的优良传统，医学教育在全国医科院校中始终处于领先地位，‘南湘雅，北协和’的确是中国医学教育的两块牌子。”
１１、应时组建中南大学，复名湘雅医学院
２０００年４月２９日，湖南医科大学、长沙铁道学院与中南工业大学合并中南大学。１１月，原湖南医科大学一块命名为中南大学湘雅医学院。
至此，湘雅医学院设有７个学院、１１０个教研室、８３个研究室及１１个研究所，拥有６个国家和部级培训中心、１个国家重点实验室、３个部省重点实验室，设有临床医学、预防医学、医学检验、口腔医学、信息管理与信息系统、麻醉学、护理学、药理学等８个系。学院６７３４名教职工中，有教授级人数３３５人、副教授级７９６人，讲师级２０１８人、中国科学院院士、中国工程院院士各１名、国务院学位委员会学科评议组成员５名、国家级及部级有突出贡献的中青年专家１９名、博士导师７４名、享受政府津贴的专家２４２名、在国际学术团体与全国性学会中任职的专家１５１名，有３个覆盖２３个学科的博士后流动站，２３个博士点、４６个硕士点。学院各类在校学生已达１０５０６人，其中本科生５３２２人、研究生７６６人。（全文完）
